MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 109476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_019965	CG	3	6	127360	127365	0 %	0 %	50 %	50 %	433640238
3003	NC_019965	CGA	2	6	127377	127382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640238
3004	NC_019965	TCG	2	6	127484	127489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640238
3005	NC_019965	CCA	2	6	127506	127511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640238
3006	NC_019965	GC	3	6	127516	127521	0 %	0 %	50 %	50 %	433640238
3007	NC_019965	CCG	2	6	127524	127529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640238
3008	NC_019965	ACC	2	6	127532	127537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640238
3009	NC_019965	GCC	2	6	127616	127621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640238
3010	NC_019965	CCG	2	6	127647	127652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640238
3011	NC_019965	CAC	3	9	127654	127662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640238
3012	NC_019965	CGG	2	6	127698	127703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640238
3013	NC_019965	CCG	2	6	127704	127709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640238
3014	NC_019965	TCA	2	6	127755	127760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640238
3015	NC_019965	TGC	2	6	127788	127793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640238
3016	NC_019965	TGC	2	6	127807	127812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640238
3017	NC_019965	GCG	2	6	127905	127910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640238
3018	NC_019965	GTC	2	6	127933	127938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640238
3019	NC_019965	GCC	2	6	127947	127952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640238
3020	NC_019965	GGGGT	2	10	128054	128063	0 %	20 %	80 %	0 %	433640238
3021	NC_019965	GCA	2	6	128073	128078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640238
3022	NC_019965	GGC	2	6	128083	128088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640238
3023	NC_019965	GCGGCA	2	12	128117	128128	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433640238
3024	NC_019965	GCTG	2	8	128155	128162	0 %	25 %	50 %	25 %	433640238
3025	NC_019965	TGG	2	6	128166	128171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640238
3026	NC_019965	CAA	2	6	128194	128199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640238
3027	NC_019965	GGT	2	6	128212	128217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640238
3028	NC_019965	GCC	2	6	128252	128257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640238
3029	NC_019965	CCG	2	6	128289	128294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640238
3030	NC_019965	TCG	2	6	128351	128356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640238
3031	NC_019965	CGG	2	6	128400	128405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640238
3032	NC_019965	CG	3	6	128455	128460	0 %	0 %	50 %	50 %	433640238
3033	NC_019965	ACC	2	6	128555	128560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640238
3034	NC_019965	GCA	2	6	128586	128591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640238
3035	NC_019965	CCCAC	2	10	128616	128625	20 %	0 %	0 %	80 %	433640238
3036	NC_019965	ACC	2	6	128654	128659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640238
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3038	NC_019965	TGCA	2	8	128842	128849	25 %	25 %	25 %	25 %	433640238
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3042	NC_019965	GCCG	2	8	129034	129041	0 %	0 %	50 %	50 %	433640238
3043	NC_019965	ACC	2	6	129052	129057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640238
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3045	NC_019965	CCGGC	2	10	129126	129135	0 %	0 %	40 %	60 %	433640238
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3050	NC_019965	CGA	2	6	129256	129261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640238
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3054	NC_019965	AGC	2	6	129383	129388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640238
3055	NC_019965	GCC	3	9	129419	129427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640238
3056	NC_019965	GCG	2	6	129434	129439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640238
3057	NC_019965	TGG	2	6	129528	129533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640238
3058	NC_019965	TGCGG	2	10	129536	129545	0 %	20 %	60 %	20 %	433640238
3059	NC_019965	GGCG	2	8	129552	129559	0 %	0 %	75 %	25 %	433640238
3060	NC_019965	CGA	2	6	129670	129675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640238
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3072	NC_019965	CGGG	2	8	130330	130337	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3073	NC_019965	ACG	2	6	130387	130392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3081	NC_019965	GCTC	2	8	130837	130844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_019965	GGT	2	6	130848	130853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_019965	ACAG	2	8	130963	130970	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3089	NC_019965	ATC	2	6	131367	131372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640240
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3100	NC_019965	GGCG	2	8	131564	131571	0 %	0 %	75 %	25 %	433640240
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3122	NC_019965	CGG	2	6	131972	131977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640240
3123	NC_019965	CGG	2	6	131993	131998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640240
3124	NC_019965	TCG	2	6	132028	132033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640240
3125	NC_019965	CGG	2	6	132038	132043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640240
3126	NC_019965	CGG	2	6	132047	132052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640240
3127	NC_019965	GCG	2	6	132070	132075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640240
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3129	NC_019965	GGC	2	6	132099	132104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640240
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3131	NC_019965	CGGGC	2	10	132149	132158	0 %	0 %	60 %	40 %	433640240
3132	NC_019965	CGGC	2	8	132163	132170	0 %	0 %	50 %	50 %	433640240
3133	NC_019965	CGG	2	6	132173	132178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640240
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3140	NC_019965	GCT	2	6	132339	132344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640240
3141	NC_019965	GGT	2	6	132354	132359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640240
3142	NC_019965	GGT	2	6	132363	132368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640240
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3144	NC_019965	CGG	2	6	132416	132421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640240
3145	NC_019965	CGG	2	6	132425	132430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640240
3146	NC_019965	GGC	2	6	132435	132440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640240
3147	NC_019965	GCG	2	6	132442	132447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640240
3148	NC_019965	CAA	2	6	132518	132523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3149	NC_019965	CCA	2	6	132656	132661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640241
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3151	NC_019965	CGG	2	6	132719	132724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640241
3152	NC_019965	GGT	2	6	132746	132751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640241
3153	NC_019965	TACA	2	8	132752	132759	50 %	25 %	0 %	25 %	433640241
3154	NC_019965	CTG	2	6	132909	132914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640241
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3158	NC_019965	ACGGCG	2	12	133047	133058	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433640241
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3164	NC_019965	TCG	2	6	133315	133320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640241
3165	NC_019965	AGG	2	6	133468	133473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3166	NC_019965	GCA	2	6	133489	133494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3167	NC_019965	GAC	2	6	133507	133512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3168	NC_019965	GC	3	6	133525	133530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3169	NC_019965	CGGG	2	8	133549	133556	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3170	NC_019965	GTCG	2	8	133617	133624	0 %	25 %	50 %	25 %	433640242
3171	NC_019965	GCG	2	6	133649	133654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640242
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3180	NC_019965	GCT	2	6	133868	133873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640242
3181	NC_019965	GCGAT	2	10	133954	133963	20 %	20 %	40 %	20 %	433640242
3182	NC_019965	CGC	2	6	133964	133969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640242
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3191	NC_019965	TCG	2	6	134416	134421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640242
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3193	NC_019965	GAC	2	6	134441	134446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640242
3194	NC_019965	CTG	2	6	134487	134492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640242
3195	NC_019965	GTG	2	6	134496	134501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640242
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3198	NC_019965	GGCCC	2	10	134673	134682	0 %	0 %	40 %	60 %	433640242
3199	NC_019965	GGT	2	6	134708	134713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640242
3200	NC_019965	CGT	2	6	134725	134730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640242
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3202	NC_019965	GCC	2	6	134817	134822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640242
3203	NC_019965	GTT	2	6	134835	134840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640242
3204	NC_019965	CGG	2	6	134893	134898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640242
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3206	NC_019965	TCGCCG	2	12	134910	134921	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433640242
3207	NC_019965	GCC	2	6	135023	135028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640242
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3209	NC_019965	CGTTG	2	10	135185	135194	0 %	40 %	40 %	20 %	433640242
3210	NC_019965	TCG	2	6	135199	135204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640242
3211	NC_019965	CGACC	2	10	135257	135266	20 %	0 %	20 %	60 %	433640242
3212	NC_019965	AGCG	2	8	135295	135302	25 %	0 %	50 %	25 %	433640242
3213	NC_019965	CAC	2	6	135341	135346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640242
3214	NC_019965	CGG	2	6	135362	135367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640242
3215	NC_019965	GGA	2	6	135395	135400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640242
3216	NC_019965	CAA	2	6	135482	135487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640242
3217	NC_019965	CCG	2	6	135625	135630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3218	NC_019965	TG	3	6	135671	135676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3219	NC_019965	TGA	2	6	135692	135697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3220	NC_019965	GTG	2	6	135708	135713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3221	NC_019965	GC	4	8	135806	135813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3222	NC_019965	ATG	2	6	135935	135940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640243
3223	NC_019965	GCC	2	6	135968	135973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640243
3224	NC_019965	CTAC	2	8	135990	135997	25 %	25 %	0 %	50 %	433640243
3225	NC_019965	CGG	2	6	136134	136139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640243
3226	NC_019965	CCGG	2	8	136150	136157	0 %	0 %	50 %	50 %	433640243
3227	NC_019965	ACC	2	6	136169	136174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640243
3228	NC_019965	CGCA	2	8	136224	136231	25 %	0 %	25 %	50 %	433640243
3229	NC_019965	ATT	2	6	136235	136240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433640243
3230	NC_019965	TCG	2	6	136250	136255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640243
3231	NC_019965	GCG	2	6	136300	136305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640243
3232	NC_019965	GGC	2	6	136342	136347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640243
3233	NC_019965	CGT	2	6	136396	136401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640243
3234	NC_019965	CCG	2	6	136462	136467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640243
3235	NC_019965	ACG	2	6	136523	136528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640243
3236	NC_019965	GCTGAT	2	12	136567	136578	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433640243
3237	NC_019965	CGA	2	6	136723	136728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640243
3238	NC_019965	CAT	2	6	136732	136737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640243
3239	NC_019965	GCA	2	6	136749	136754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640243
3240	NC_019965	GGC	2	6	136759	136764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640243
3241	NC_019965	CAA	2	6	136778	136783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640243
3242	NC_019965	ATT	2	6	136821	136826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433640243
3243	NC_019965	GAG	2	6	136887	136892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_019965	GAG	2	6	136956	136961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640244
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3489	NC_019965	GTA	2	6	147441	147446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3490	NC_019965	GCC	2	6	147466	147471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3491	NC_019965	AGT	2	6	147495	147500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3492	NC_019965	GCC	2	6	147512	147517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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